2006
3.5-4.2   사순특강 - '주님의 수난 회개와 은총으로의 초대'
  03 월   상반기 성서강좌
    - 화요 성서반 (함세웅 신부) / 수요 사회교리반 (김홍진 신부) / 신학강좌 (오민환 연구원)
06.12   연구원 창립 10주년 기념미사 (제기동성당)
06.17   기도서 시리즈 1 ≪“나의 백성을 위로하여라”≫ 발간
09 월   하반기 성서강좌
    - 화요 성서반 (함세웅 신부) / 수요 사회교리반 (김홍진 신부) / 신학강좌 (오민환 연구원)
10.30   제7회 심포지엄 ‘신앙의 부재, 신학의 부재? (장소: 가톨릭회관 3층 강당)
11 월   사제들을 위한 강론길잡이 <선포와 봉사> 발행(2007년 다해 제50-55권)
    ※ 2007년 다해부터는 1년분을 6권으로 확정
12.16-17   성서반. 신학반. 후원회장단 피정 (장소: 횡성 도미니코 수녀원)
2007
2-3 월   사순특강 “모든 것을 쓰레기로 여깁니다” - 사순절을 보내는 우리의 다짐
  03 월   상반기 성서강좌
    - 화요 성서반 (함세웅 신부) / 수요 사회교리반 (김홍진 신부) / 신학강좌 (오민환 연구원)
06.04   후원회원의 날 (장소: 문정동성당)
09 월   하반기 성서강좌
    - 화요 성서반 (함세웅 신부) / 수요 사회교리반 (김홍진 신부) / 신학강좌 (오민환 연구원)
10.29   제8회 심포지엄 - 주제: “민주화 여정과 한국교회” (장소: 가톨릭회관 7층, 오후 2~5시)
11 월   사제들을 위한 강론길잡이 <선포와봉사> 발행(2008년 가해 제56-61권)
12.14-15   성서반. 신학반. 후원회장단 피정 (장소: 횡성 도미니코 수녀원)
2008
01.21   <기쁨과희망> 창간 준비호 발행- 87년 민주화 이후 한국천주교회 진단
  2~3 월   사순특강 - “용기를 내어라. 내가 세상을 이겼다.”
3 월   상반기 성서강좌 - 화요 성서반 (함세웅 신부) / 목요 신학강좌 (오민환 연구원)
06.09   <기쁨과희망> 창간호 발행 - 특집: ‘실용'의 논리와 십자가의 지혜
    후원회원의 날 (장소: 용문청소년수련관)
06.15   윤형중신부님 29주년 추념 행사 (장소: 명동 꼬스트홀)
09 월   하반기 성서강좌
    - 화요성서반 (함세웅 신부) / 수요사회교리반 (이강서 신부) / 목요신학강좌 (오민환 연구원)
10.27   제9회 정기 심포지엄 ? 주제: 소통-교회, 어떻게 나누고 함께할 것인가? (가톨릭회관 3층)
11.10   마크 엘리스 초청강연회 : ‘홀로코스트신학과 제국주의신학' (장소: 정동 프란치스코회관)
11 월   사제들을 위한 강론길잡이 <선포와봉사> 발행 (2009년 나해, 제62-67권)
12.09   <기쁨과희망> 제2호 발행- 소통-교회, 어떻게 나누고 함께 할 것인가?
2009
3.1-29   사순특강 - ‘속죄의 시기, 은총의 때' - 신앙인은 무엇을 할 것인가?
  03 월   상반기 성서강좌
    - 화요성서반 (함세웅 신부) / 수요사회교리반 (이강서 신부) / 목요신학강좌 (오민환 연구원)
06.09   <기쁨과희망> 제3호 발행- 2009년도 여름, 희망을 찾다
06.15   후원회원의 날 - ‘교회의 사람'을 찾아서 (장소: 명동성당꼬스트홀)
    윤형중신부 30주기 추모미사와 회고, 자료집 발간, 공개토론
09 월   하반기 성서강좌
    - 화요성서반 (함세웅 신부) / 수요사회교리반 (이강서 신부) / 목요신학강좌 (오민환 연구원)
10.22   제10회 국제학술대회(정기 심포지엄 대체)
    (장소: 고려대학교 역사박물관 세미나실 안중근의사기념사업회)
10.26   안중근 하얼빈 의거100주년 기념미사 (장소: 명동대성당 6시)
11 월   사제들을 위한 강론길잡이 <선포와 봉사> 발행(2010년 다해, 제68-73권)
12.14   <기쁨과 희망> 제4호 발행- 위기의 한국사회와 한국교회
12.19   동숭동 ‘광장' 빌딩 매각관계로 잠실 올림피아빌딩 301호로 연구원 이전
2010
3 월   상반기 성서강좌 - 화요 성서반 (함세웅 신부) / 목요 신학강좌 (오민환 연구원)
  3.25-27   안중근의사 순국100주년 기념 “남·북한 공동 추모방문” ( 중국 여순등 안중근의사 관련유적지)
05.24   <기쁨과희망> 제5호 발행- 교회와 정치의 지형도
06.14   후원회원의 날 (장소: 북여주성당, 신륵사, 흥원창, 부론성지 순례)
9 월   상반기 성서강좌 - 화요성서반 (함세웅 신부) / 목요신학강좌 (오민환 연구원)
                             금요사회교리연구모임 (김홍진 신부)
10.27   제11회 심포지엄 ‘말을 열다, 길을 트다' (장소: 가톨릭회관 1층)
11 월   사제들을 위한 강론길잡이 <선포와봉사> 발행(2011년 가해, 제74-79권)
12.14   <기쁨과 희망> 제6호 발행 - 말을 열다, 길을 트다 - 언론과 교회의 시대적 책임과 반성